校内与知网查重在检测学术论文时有着不同的侧重点。校内查重主要针对学生提交的作业、论文等文本进行查重，以确保学生的学术诚信；而知网查重则是专业的学术领域查重工具，主要用于检测学术论文的原创性和学术诚信。校内查重通常由学校自行开发或购买软件服务，而知网是一个专业的学术资源库，提供高效的查重服务。

另外，校内查重和知网查重在使用范围和目的上也存在差异。校内查重主要应用于学生作业、毕业论文等文本的查重，其目的是教育学生遵守学术规范，培养学生的学术诚信意识；而知网查重则更多用于科研人员、学术期刊编辑等专业人士检测论文的原创性和学术诚信，以确保学术界的学术规范和水平。因此，校内查重和知网查重虽然都是查重工具，但在功能和使用对象上有着明显的区别。